sabato 2 maggio 2015

Spugne, collagene e colpi a segno!




Molecular Cloning, Characterization, and Expression Analysis of ...
aggiornamento flash del blog, per non lasciare i nostri followers in ansia. é finalmente online l'ultimo articolo al quale hanno collaborato i membri dell'equipaggio del lab3: "Molecular Cloning, Characterization, and Expression Analysis of a Prolyl 4-Hydroxylase from the Marine Sponge Chondrosia reniformis." scritto da Marina Pozzolini (il nostro primo autore, e vai!) Sonia Scarfì, Francesca Mussino, Sara Ferrando, Lorenzo Gallus (questi ultimi due vecchie conoscenze dell'equipaggio del lab3 che hanno svolto un ruolo di supporto) e Marco Giovine, ultimo nome del lavoro (non a caso…), pubblicato dalla rivista Marine Biotechnology.
il link all'articolo
... dell'equipaggio del lab3 che ha svolto un ruolo di supporto.
per chi fosse interessato a questo bersaglio del lab3 entriamo un poco nel dettaglio del lavoro; la prolil-4-idrossilasi (P4H) è un enzima chiave nella sintesi del collagene ed è costituita da due subunità funzionali.
il link alla voce collagene su Wikipedia.

é stato clonato il cDNA e studiata l'espressione di queste due subunità del P4H in una spugna marina, di notevole interesse biologico, la Chondrosia reniformis (Nardo, 1847). si tratta di una spugna appartenente alla classe delle demosponge, senza endoscheletro e spicole, che può includere sabbie silicee e altri materiali silicei.
Chondrosia reniformis (Nardo, 1847) sezione istologica, foto degli autori.
il link alla Chondrosia reniformis (Nardo, 1847) su Wikipedia.

la P4H appare lontana filogeneticamente da quelle conosciute negli invertebrati anzi avrebbe una struttura quaternaria simile a quella di enzimi omologhi dei vertebrati. é stato indagato l'effetto di silicati solubili e dell'acido ascorbico, e il coinvolgimento di fattori di necrosi tumorale nella formazione della matrice della spugna. questo potrebbe aiutare per la produzione di collagene ricombinante ottenuto da spugne marine e per la comprensione dei meccanismi della deposizione di matrice extracellulare implicati in fenomeni patologici negli organismi superiori.
la navigazione del lab3 non si ferma però al primo approdo, anche se accogliente, tutt'altro.
l'equipaggio del lab3 continua la sua navigazione
altri bersagli sono inquadrati nei radar e siluri fotonici sono in viaggio verso i loro bersagli.
siluri fotonici lanciati... e siamo in attesa dell'impatto con i bersagli
speriamo presto di potervi segnalare altri colpi messi a segno, in queste acque perigliose dove navighiamo qui, vicino al Maelstrom della conoscenza, sull'orlo della biologia.

al lavoro... a oltranza!
e per finire un po' di autopromozione: iscrivetevi al theblog3, per avere gli aggiornamenti in tempo reale! ^_^

iscrivetevi al blog :) 

sabato 4 aprile 2015

Ancora aggiornamenti veloci, dal Museo Antartico di Genova rinnovato!



pochi giorni or sono è accaduto un fatto, in se piccolo, ma che è stato ripreso dalla stampa, sia locale che nazionale. dopo molti lavori per il suo rinnovamento è stato riaperto a Genova, in Porto Antico, presso Palazzina Millo, il Museo Nazionale dell'Antartide Felice Ippolito, l'MNA, nella sua sezione di Genova.

Antartide modello con altimetria esagerata al MNA Felice Ippolito di Genova

durante l'inaugurazione ci si è potuti mettere in contatto via satellite con la base italo/francese di Concordia attraverso skype e l'emozione è stata palpabile.

in contatto via satellite con la base italo/francese di Concordia
per la sua posizione strategica e la collaborazione stretta con l'Acquario di Genova l'MNA si accinge ad essere sempre di più un punto importante per la divulgazione scientifica e una vetrina delle attività antartiche italiane che si protraggono oramai continuativamente da oltre trent'anni. in realtà si tratta solo del centro espositivo, la punta dell'iceberg (lo so, non mi si perdonerà mai un simile gioco di parole!) del cosiddetto sorting center rappresentato dalla struttura di ricerca scientifica, conservazione, catalogazione dei campioni provenienti dalle spedizioni antartiche inserita in una complessa rete nazionale

La stazione Mario Zucchelli, prima conosciuta come BTN (Baia Terra Nova)

sicuramente gran parte del merito va all'attuale Direttore del museo, la Prof. Maria Angela Masini, del DiSTAV e al suo Responsabile Scientifico il Dott. Stefano Schiapparelli, sempre del DiSTAV.

una nota è rappresentata anche dal nome dell'MNA, Felice Ippolito. chi fu questo italiano, scienziato, politico, sognatore, uomo che ha superato traversie non sempre lievi

Link lo potete trovare qui:

ammetto che l'interesse per l'ambiente antartico ha per l'equipaggio del lab3 origini abbastanza lontane, come testimoniato da questi reperti bibliografici del sottoscritto:

un Lorenzo Gallus "ultimo nome" solo per caso! dal lontano 1998
e ancora un primo lavoro antartico di un membro del lab3 che risale però a tempi molto più recenti

il Pleuragramma antarctica è una star dell'ecosistema antartico, vero Dott.ssa Sara Ferrando?
ultimamente poi, grazie alla possibilità di collaborare con i biologi Marino Vacchi, Eva Pisano e Laura Ghigliotti e grazie al lavoro dell'Acquario di Genova da sempre impegnato con la divulgazione e con il suo know-how nella difesa e valorizzazione dell'ambiente antartico, si è riusciti a conseguire dei risultati molto incoraggianti ^_^

Link un recentissimo articolo del lab3 su organismi antartici

parafrasando il motto dell'Apollo 13 "Ex Antarctica Scientia"


che dire ancora? ci aspettiamo molto dalle collaborazioni del lab3 con gli esperti dell'Antartide e dai suoi esploratori, e più in generale, dalla collaborazione con chi studia gli ambienti polari sia Antartici che Artici, ora l'attenzione sugli organismi antartici del lab3 oltre che essere sempre sul Pleuragramma antarctica (nome attualmente accettato del Pleuragramma antarcticum… dato che i tassonomisti si sono detti che il latino non è un'opinione!) si è spostata anche sul Dissosticus mawsoni (teleosteo antartico), come abbiamo avuto modo di dire nell'ultimo post. quindi mentre voi andrete presumibilmente a visitare il MNA rinnovato e più interattivo che mai nel lab3 procederà la navigazione e la ricerca in attesa di preziosi nuovi campioni da studiare.

chiudo questo veloce ma denso aggiornamento del blog del lab3 augurandovi una Serena Pasqua e dandovi appuntamento al prossimo aggiornamento!

il coniglio pasquale (by Sara) vi augura buone feste



sabato 21 marzo 2015

Aggiornamenti veloci, funghi, pesci artici e tanto caldo.



Aggiornamenti veloci. non li facciamo spesso ma oggi ne arriva uno. il lab3 è sotto pressione.
... sotto pressione o se preferite in ebollizione.
c'è una scadenza ravvicinata. un progetto deve essere presentato entro breve. il ruolo del lab3 è secondario e la coordinatrice del progetto sta lavorando sodo per presentarlo, ma l'impegno da parte dei membri del lab3 è comunque richiesto. per questo motivo si sono sospese momentaneamente le attività non finalizzate al progetto e non obbligatorie (non sono molte ma si fa il possibile). ovviamente le lezioni e i laboratori e le collaborazioni che richiedono una tempistica programmata non si sospendono… 
i laboratori si devono pur tenere
continua pure l'analisi dei campioni sotto esame, ma tutto il resto del tempo va alla stesura della nostra parte di progetto, è troppo importante per noi preparare progetti solidi e interessanti.
 
l'analisi dei campioni urgenti continua... anche in treno!

intanto cerchiamo di conoscere un poco uno degli organismi ai quali si sta volgendo l'attenzione del lab3, il pesce antartico Toothfish, o Dissostichus mawsoni, sul quale torneremo poi in futuro, (si spera!):  http://it.wikipedia.org/wiki/Dissostichus_mawsoni
http://it.wikipedia.org/wiki/Dissostichus_mawsoni#/media/File:Dmawsoni_Head_shot.jpg
mentre le attività procedono più lentamente ecco che il lab3 si trova ad aver superato l'equinozio di primavera e che la temperatura esterna si sta finalmente alzando, rendendo le attività più piacevoli, cosa che permetterà alla Sara Ferrando di mettersi addosso meno maglioni mentre tiene la barra del timone del laboratorio.
la plancia del lab 3 è un po' fredda e il tepore primaverile è atteso con piacere
approfittiamo allora di questo brevissimo aggiornamento per riportare un evento molto interessante per gli amanti della natura, gli specialisti del verde e affini (!) e anche quelli della buona cucina:  sono infatti aperte le iscrizione per il corso di formazione per il conseguimento dell’attestato di Micologo ai sensi del DM 686/96. Regione Liguria, biennio 2015 – 2016.
 
Corso di formazione per il conseguimento dell’attestato di MICOLOGO
Tutte le informazioni sono disponibili sul sito  
Ringraziamo qui il Dott. Antonio Sarà che ci ha messo prontamente al corrente del corso! se la trovate una iniziativa interessante condividetela!
per finire questo post riportiamo un articolo recente che richiama nuovamente l'attenzione su di una realtà che non possiamo più nascondere, e che ci sprona a collaborare con i ricercatori esperti di artico e antartico per dare il nostro piccolo contributo alla salvaguardia di questi ambienti estremi, delicati e minacciati: http://www.repubblica.it/ambiente/2015/03/20/news/artico_ghiaccio_ai_minimi_storici_anche_d_inverno-110017108/
Antartide! da Google Earth
 un saluto quindi dall'equipaggio del lab3 che continua la sua navigazione tra scienza, didattica e burocrazia
 
l'equipaggio del lab 3 al lavoro